Ascaris lumbricoides: 508 contigs; 42919 codons AMINO ACID FREQUENCIES ====================== A Ala 3142 7.32 % C Cys 1120 2.6 % D Asp 1970 4.59 % E Glu 2469 5.75 % F Phe 2102 4.89 % G Gly 2633 6.13 % H His 1060 2.46 % * stop 27 0.06 % I Ile 2582 6.01 % K Lys 2742 6.38 % L Leu 3564 8.3 % M Met 1091 2.54 % N Asn 1836 4.27 % P Pro 2276 5.3 % Q Gln 1514 3.52 % R Arg 2650 6.17 % S Ser 3157 7.35 % T Thr 2219 5.17 % V Val 2780 6.47 % W Typ 532 1.23 % Y Tyr 1453 3.38 % CODON USAGE FREQUENCIES ======================= A Ala GCA 997 2.32 % A Ala GCC 656 1.52 % A Ala GCG 750 1.74 % A Ala GCT 739 1.72 % C Cys TGT 546 1.27 % C Cys TGC 574 1.33 % D Asp GAC 808 1.88 % D Asp GAT 1162 2.7 % E Glu GAA 1367 3.18 % E Glu GAG 1102 2.56 % F Phe TTC 1190 2.77 % F Phe TTT 912 2.12 % G Gly GGA 817 1.9 % G Gly GGC 739 1.72 % G Gly GGG 293 0.68 % G Gly GGT 784 1.82 % H His CAC 438 1.02 % H His CAT 622 1.44 % * stop TAA 14 0.03 % * stop TAG 5 0.01 % * stop TGA 8 0.01 % I Ile ATA 566 1.31 % I Ile ATC 1026 2.39 % I Ile ATT 990 2.3 % K Lys AAA 1465 3.41 % K Lys AAG 1277 2.97 % L Leu CTA 352 0.82 % L Leu CTC 689 1.6 % L Leu CTG 574 1.33 % L Leu CTT 739 1.72 % L Leu TTA 456 1.06 % L Leu TTG 754 1.75 % M Met ATG 1091 2.54 % N Asn AAC 809 1.88 % N Asn AAT 1027 2.39 % P Pro CCA 739 1.72 % P Pro CCC 418 0.97 % P Pro CCG 557 1.29 % P Pro CCT 562 1.3 % Q Gln CAA 864 2.01 % Q Gln CAG 650 1.51 % R Arg AGA 432 1 % R Arg CGA 489 1.13 % R Arg AGG 312 0.72 % R Arg CGC 536 1.24 % R Arg CGG 210 0.48 % R Arg CGT 671 1.56 % S Ser AGC 523 1.21 % S Ser TCA 658 1.53 % S Ser TCC 379 0.88 % S Ser AGT 436 1.01 % S Ser TCG 705 1.64 % S Ser TCT 456 1.06 % T Thr ACA 672 1.56 % T Thr ACC 498 1.16 % T Thr ACG 552 1.28 % T Thr ACT 497 1.15 % V Val GTA 462 1.07 % V Val GTC 603 1.4 % V Val GTG 864 2.01 % V Val GTT 851 1.98 % W Typ TGG 532 1.23 % Y Tyr TAC 598 1.39 % Y Tyr TAT 855 1.99 % # - number of times the codon is observed % - relative aa / codon usage value (usage of a given codon among its redundant set, i.e. the set of codons which code for this codon's amino acid).